Tartuntatautien vastustamistyö vankiloissa on tartuntatautilain mukaan myös valtion velvollisuus. HIV-ja hepatiittitartuntoja torjutaan vankiloissa terveyskasvatuksella ja varmistamalla suojautumismahdollisuudet. Jokaiselle vangille jaettavassa hygieniapakkauksessa on ohjeet kondomin käytöstä sekä pistosvälineiden puhdistamisesta ja hävittämisestä, samoin kuin henkilökohtaiset desinfektiotarvikkeet. Myös vankilan poliklinikalta on mahdollisuus saada puhdistusvälineitä omaan käyttöön.
Tartunnat pyritään toteamaan mahdollisimman varhain vapaaehtoisilla testeillä. Vankiloissa annetaan riskiryhmille maksuton A- ja B-hepatiittirokotus. Erityisesti ruiskuhuumeita käyttäneiden hakeutumista HIV-testiin kannustetaan vankiloissa.